Hola Suizo, buenas preguntas (De respuesta compleja)
Un paludario no desprende olores siempre y cuando:
El habitáculo en su conjunto posea adecuada ventilación, necesaria además para evitar condensaciones que impidan la visión y sobretodo para controlar el clima.
Las zonas terrestres (Suelos) dispongan de buen drenaje. Las zonas terrestres verticales carecen de suficiente espesor como para producir gases en condiciones anaerobias salvo si incrustamos macetas sin drenar. Además, estas zonas verticales están fuertemente irrigadas por sistemas de nebulizado o goteo.
El "hardware vegetal" (Troncos, raíces y hojas) deben estar curados previamente o poseer condiciones hidrófugas (Maderas resistentes al agua) del mismo modo que en un acuario.
Un acuaterrario sano y bien ventilado depura el aire de forma inapreciable pero no lo carga.
Mírate el apartado "ANOXIA- ZONAS ANAERÓBICAS":
http://www.zootecniadomestica.com/acuaterrarios-consideraciones/Sobre si debe taparse o no un acuaterrario "ABIERTOS Y CERRADOS":
http://www.zootecniadomestica.com/acuaterrarios-tipos/Las plagas puntuales son habituales. De hecho en mi caso era lo deseable y las provocaba antes de introducir animales insectívoros (Colémbolos, drosophila, enquitreidos, lombrices...) El control de las mismas lo llevan a cabo los habitantes y las rejillas antidrosófila evitan su escape en sistemas cerrados. Esto cuando hay zona terrestre horizontal (Suelo)
Un paludario tradicional que carece de suelo pues toda su base es agua, raramente produce plagas (Salvo colémbolos y drosófila ocasionalmente) pues la zona terrestre es vertical y drena constantemente.
Si te animas, comenta por aquí y lo vamos enfocando. Un saludo.